病理學為臨床醫學的基礎，病理檢查與醫學檢驗則為疾病診斷與治療的依據。為提供雲嘉南地區民眾優質的病理檢驗服務品質，成大醫院依序於73年8月在醫學院成立病理學科，再於77年1月成立附設醫院病理部，由病理科教師兼任病理部主治醫師，並由病理學科主任兼任病理部主任。

        成醫病理部迄今30餘年，歷任主任分別為：曾楨皓教授76.02 ~ 78.01、李玉雲教授78.02 ~ 78.07、范抗教授78.08 ~ 79.07、靳應臺教授79.08 ~ 79.11、劉湘梅教授79.12 ~ 83.07、葉純甫教授83.08 ~ 84.02、蘇益仁教授84.02 ~ 87.07、靳應臺教授 87.08 ~ 93.07、周楠華教授93.08 ~ 96.07、李玉雲教授96.08 ~ 97.07、顏經洲教授 97.08~103.07、張孔昭教授103.08~109.07、蕭振仁教授109.08~111.07、蔡弘文教授111.08迄今。並為加強實驗室品質管理系統及研發能力，促使臨床服務、研究與教學緊密結合，自83年起延攬醫技系、病理學科、分醫所、婦產部、皮膚部‧‧‧等科部老師擔任全職或部份時間顧問，共同為成醫檢驗品質提昇而努力。

        本部各項服務於77年本院開幕時即全面上線，包括：外科病理、細胞病理、微生物、電子顯微鏡、細胞遺傳、生化、血清免疫、血液、血庫、急診、門診‧‧‧等業務。隨著檢驗技術進步及新興疾病發展，於78年增設毒物室、84年創立病毒室、88年成為衛生署疾管局病毒合約實驗室、93年新設品保組及分子診斷組、104年成立鏡檢組。 　　

        本部不僅提供了南部民眾一流的醫學檢驗服務，對台灣的防疫亦貢獻卓著。本部於84在耶魯大學熊菊貞教授與醫技系王貞仁教授協助下成立病毒室。不久，便遭逢腸病毒大爆發。在蘇益仁主任整合所有檢驗資源下，全力投入相關研究，解開腸病毒71型疫情之謎，也使成大成為全球該領域相關研究之翹楚。 　　

        「愛心關懷、追求卓越」是病理部同仁共同信念，本部已於96年通過TAF醫學實驗室認證，務求各項檢驗品質穩定一致、各檢驗部門均衡發展。99年新院區開幕後，將抽血服務由住院大樓搬遷進入新大樓一樓，明亮寬敞的空間令人驚豔，以全新面目綻現，服務品質得到大幅度的改善。